[发明专利]一种染色体倍数异常检测方法及检测系统有效

专利信息
申请号: 201910503326.9 申请日: 2019-06-11
公开(公告)号: CN110428873B 公开(公告)日: 2021-07-23
发明(设计)人: 张军英;蒋玉婷;袁细国 申请(专利权)人: 西安电子科技大学
主分类号: G16B40/20 分类号: G16B40/20;G16B20/50
代理公司: 西安长和专利代理有限公司 61227 代理人: 黄伟洪
地址: 710071 陕西省*** 国省代码: 陕西;61
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摘要: 发明属于医学染色体异常信息检测技术领域,公开了一种染色体倍数异常检测方法及检测系统,通过样本数据预处理后,得到样本的每条染色体reads值,使用t‑test对样本进行检验,并估计空假设下统计量Ratio的期望值与标准差;在得到标准差与期望值之后,计算出Ratio值:计算出Ratio值后,对于不同类型的染色体,使用不同的参照组计算不同的z值;计算不同的z值后,利用决策树分类算法对于性染色体染色体进行检测。本发明选择参照组时,对参照组的选取按照检测的对象分别设置;本发明前期对数据进行大量的去重等预处理手段,以及决策树算法与随机森林算法使得检测结果更加准确。
搜索关键词: 一种 染色体 倍数 异常 检测 方法 系统
【主权项】:
1.一种染色体倍数异常检测系统,其特征在于,所述染色体倍数异常检测系统包括:预处理模块,用于样本数据预处理,得到样本的每条染色体reads值;检验模块,用于使用t‑test对样本进行检验,并估计空假设下统计量Ratio的期望值与标准差;计算模块,用于在得到标准差与期望值之后,计算出Ratio值:计算出Ratio值后,对于不同类型的染色体,使用不同的参照组计算不同的z值;检测模块,用于计算不同的z值后,利用决策树分类算法对于性染色体染色体进行检测。
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