[发明专利]一种蛋白质磷酸化位点识别方法、系统、装置及存储介质有效
| 申请号： | 201910569671.2 | 申请日： | 2019-06-27 |
| 公开（公告）号： | CN110349628B | 公开（公告）日： | 2021-06-15 |
| 发明（设计）人： | 李占潮;邹小勇;戴宗 | 申请（专利权）人： | 广东药科大学;中山大学 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G06N3/00 |
| 代理公司： | 广州嘉权专利商标事务所有限公司 44205 | 代理人： | 许飞 |
| 地址： | 510240 广东省广州*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种蛋白质磷酸化位点识别方法、系统、装置及存储介质，该方法包括：获取待识别蛋白质磷酸化位点的氨基酸序列片段；对所述氨基酸序列片段中氨基酸的二进制编码进行逻辑操作，获得所述氨基酸序列片段的逻辑二进制特征向量；根据预设的核函数，对所述逻辑二进制特征向量进行核主成分分析，获得核主成分逻辑二进制特征向量；将所述核主成分逻辑二进制特征向量输入到随机森林模型中进行处理，获得所述蛋白质磷酸化位点的识别结果。该发明基于随机森林模型的理论计算，能够快速准确地识别大量蛋白质磷酸化位点信息，且成本低，有助于磷酸化机理以及磷酸化与疾病关系研究的开展，广泛应用蛋白质磷酸化位点识别领域。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 蛋白质 磷酸化 识别 方法 系统 装置 存储 介质 | ||
【主权项】：
1.一种蛋白质磷酸化位点识别方法，其特征在于，包括以下步骤：获取待识别蛋白质磷酸化位点的氨基酸序列片段；对所述氨基酸序列片段中氨基酸的二进制编码进行逻辑操作，获得所述氨基酸序列片段的逻辑二进制特征向量；根据预设的核函数，对所述逻辑二进制特征向量进行核主成分分析，获得核主成分逻辑二进制特征向量；将所述核主成分逻辑二进制特征向量输入到随机森林模型中进行处理，获得所述蛋白质磷酸化位点的识别结果。
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