[发明专利]一种基于复杂网络结构可控性基因的识别方法有效
申请号: | 201910576809.1 | 申请日: | 2019-06-28 |
公开(公告)号: | CN110504004B | 公开(公告)日: | 2022-02-22 |
发明(设计)人: | 金海燕;曹甜;王炳波;王婉宁 | 申请(专利权)人: | 西安理工大学 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00 |
代理公司: | 西安弘理专利事务所 61214 | 代理人: | 杜娟 |
地址: | 710048*** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | 本发明提供了一种基于复杂网络结构可控性基因识别方法,在于构建可控性节点分类框架,将基因分成控制角色差异的不同类型,通过统计显著性识别新的基因,基于可控性节点分类框架的基因识别方法考虑了网络中的全局信息,从多个控制层面实现了基因的分类,并且将该框架应用于组织特异的调控网络中,能够系统性地检测出具有显著生物意义的基因,为进一步的基因研究提供工具平台。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 复杂 网络 结构 可控性 基因 识别 方法 | ||
【主权项】:
1.一种基于复杂网络结构可控性基因识别方法,其特征在于,包括如下步骤:/n步骤1:读取组织特异调控网络的数据/n原始数据中每行包含两列数据,分别表示调控基因和被调控基因;/n步骤2:利用四种不同的节点分类方法分别对网络中的节点做分类/n第一种是基于可控性的节点分类方法;/n第二种是基于控制能力的节点分类方法;/n第三种是基于控制功能来源的节点分类方法;/n第四种是基于控制边鲁棒性的节点分类方法;/n步骤3:将步骤2中四种分类结果结合起来,对网络中的每个节点的类型用一个四维向量来表示,形成可控性节点分类框架;/n步骤4:在多个金标准数据集上利用统计显著性公式找出一类具有显著生物意义的基因作为候选基因;/n步骤5:利用相关性度量指标从步骤4中的候选基因中筛选出特异基因。/n
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