[发明专利]基于同源建模的高效检测PAEs的牛血清蛋白改造方法有效

专利信息
申请号: 201910599478.3 申请日: 2019-07-04
公开(公告)号: CN110317263B 公开(公告)日: 2021-03-23
发明(设计)人: 李鱼;邱尤丽;张书京;杜美锦 申请(专利权)人: 华北电力大学
主分类号: C07K14/765 分类号: C07K14/765;G16B5/00;G16B15/20
代理公司: 北京市商泰律师事务所 11255 代理人: 邹芳德
地址: 102206 北京市*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供了一种基于同源建模的高效检测PAEs的牛血清蛋白改造方法,属于光谱检测技术领域。该方法去除牛血清蛋白结构中的水分子,并加氢和电荷,将目标PAEs分子融入受体结合腔中,将牛血清蛋白活性位点处的亲水性氨基酸替换为疏水性氨基酸;用同源建模方法构建出氨基酸替换后的牛血清蛋白的结构;利用PROCHECK服务器对牛血清蛋白结构进行筛选,图谱显示所有氨基酸残基均位于可允许区,且落在最适区+允许区+最大允许区的氨基酸残基百分比均满足大于95%,获得高效检测PAEs的牛血清蛋白。本发明方法操作简便、计算快速、容易实现,实现了与目标PAEs结合亲和力提高且荧光光谱强度增强的新型牛血清蛋白,为实现PAEs的高灵敏性荧光光谱检测提供直接的理论指导。
搜索关键词: 基于 同源 建模 高效 检测 paes 血清 蛋白 改造 方法
【主权项】:
1.一种基于同源建模的高效检测PAEs的牛血清蛋白改造方法,其特征在于,包括如下流程步骤:步骤S110:去除牛血清蛋白结构中的水分子,并进行加氢和加电荷处理,确定牛血清蛋白的受体结合腔;步骤S120:将目标PAEs分子融入受体结合腔中,与牛血清蛋白进行半柔性对接,获得目标PAEs分子周围所包含的氨基酸残基;步骤S130:将牛血清蛋白活性位点处的亲水性氨基酸替换为疏水性氨基酸;步骤S140:用同源建模方法构建出氨基酸替换后的牛血清蛋白的结构;步骤S150:利用PROCHECK服务器对步骤S140得到的牛血清蛋白结构进行筛选,获得满足一定条件的牛血清蛋白的结构,即为所述高效检测PAEs的牛血清蛋白;其中,所述满足一定条件包括,当图谱显示所有氨基酸残基均位于可允许区,且落在最适区+允许区+最大允许区的氨基酸残基百分比均满足大于95%。
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