[发明专利]蛋白质序列数据库并行搜索鉴定方法与装置在审
| 申请号： | 201910604573.8 | 申请日： | 2019-07-05 |
| 公开（公告）号： | CN110277136A | 公开（公告）日： | 2019-09-24 |
| 发明（设计）人： | 李肯立;李闯;唐卓;陈建国;刘勇刚;李克勤;廖湘科 | 申请（专利权）人： | 湖南大学 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B50/30;G01N33/68 |
| 代理公司： | 广州华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人： | 黄晶晶 |
| 地址： | 410001 湖*** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | 本申请涉及一种蛋白质序列数据库并行搜索鉴定方法、装置、计算机设备和存储介质，其中，方法包括：预处理待鉴定的实验质谱数据集和蛋白质序列数据库，对蛋白序列数据库中每条蛋白序列进行模拟酶切，获取理论质谱数据集；分别提取实验质谱数据集对应的每个实验质谱图的质谱峰，生成搜索查询集合，并根据搜索查询集合在蛋白质序列库中搜索理论质谱数据集，获取候选肽段序列集合；根据每个实验质谱图及其对应的候选肽段序列集合，生成候选肽段并打分；整合打分结果，并进行肽段到蛋白质的推断，得蛋白质鉴定结果，采用并行处理的方式显著提高蛋白质序列数据库搜索鉴定效率。 | ||
| 搜索关键词： | 实验质谱 数据集 蛋白质序列数据库 候选肽 并行搜索 理论质谱 搜索查询 序列集合 集合 搜索 预处理 蛋白序列数据库 蛋白质鉴定 蛋白质序列 计算机设备 序列数据库 并行处理 存储介质 蛋白序列 模拟酶切 种蛋白质 质谱峰 整合 肽段 推断 蛋白质 申请 | ||
【主权项】：
1.一种蛋白质序列数据库并行搜索鉴定方法，所述方法包括：预处理待鉴定的实验质谱数据集和蛋白质序列数据库；对所述蛋白序列数据库中每条蛋白序列进行模拟酶切，获取理论质谱数据集；分别提取所述实验质谱数据集对应的每个实验质谱图的质谱峰，生成搜索查询集合，并根据所述搜索查询集合在所述蛋白质序列库中搜索所述理论质谱数据集，获取候选肽段序列集合；根据每个实验质谱图及其对应的候选肽段序列集合，生成候选肽段并打分；整合打分结果，并进行肽段到蛋白质的推断，得蛋白质鉴定结果。
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