[发明专利]一种菌群标记物的检测方法、检测系统及终端有效
| 申请号： | 201910609866.5 | 申请日： | 2019-07-08 |
| 公开（公告）号： | CN110444254B | 公开（公告）日： | 2021-10-19 |
| 发明（设计）人： | 陈允文;蔡云鹏;林淑芳 | 申请（专利权）人： | 深圳先进技术研究院;深圳市万机创意电子科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00 |
| 代理公司： | 深圳中一联合知识产权代理有限公司 44414 | 代理人： | 黄志云 |
| 地址： | 518055 广东省深圳*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本申请适用于生物技术领域，提供一种菌群标记物的检测方法、检测系统及终端，其中方法包括：获取菌群样本数据；根据所述菌种分类单元的代表序列，采用系统发育树算法，获取不同的菌种分类单元之间的相似度，并得到对应的相似度矩阵；根据所述样本类标、所述不同菌种所属的菌种分类单元的丰度及所述相似度矩阵，通过广义套索回归算法模型，得到与设定拟合效果相对应的目标回归系数向量；将所述目标回归系数向量中非零系数元素对应的菌种分类单元确定为目标菌群标记物，提升筛选出的菌群标记物的有效性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 标记 检测 方法 系统 终端 | ||
【主权项】：
1.一种菌群标记物的检测方法，其特征在于，包括：获取菌群样本数据，所述菌群样本数据中包括：样本类标、样本中不同菌种所属的菌种分类单元的丰度及所述菌种分类单元的代表序列；根据所述菌种分类单元的代表序列，采用系统发育树算法，获取不同的菌种分类单元之间的相似度，并得到对应的相似度矩阵；根据所述样本类标、所述不同菌种所属的菌种分类单元的丰度及所述相似度矩阵，通过广义套索回归算法模型，得到与设定拟合效果相对应的目标回归系数向量；将所述目标回归系数向量中非零系数元素对应的菌种分类单元确定为目标菌群标记物。
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