[发明专利]基于KASP技术开发的玉米核心SNP标记及其应用

摘要

本发明提供一套基于KASP技术开发的玉米核心SNP标记及其应用。本发明利用生物信息学方法从大量种质资源基因型数据中挑选出22个玉米核心SNP标记。利用该套SNP标记组合对玉米材料进行检测，更精准、高效。在DNA质量满足一般KASP反应(或常规PCR反应)需求的情况下，检测的准确度和分辨率均很高，检测效率是SSR标记的10‑20倍，检测成本与SSR标记相当，同时检测过程中无需使用丙烯酰胺等有毒化学试剂。此外，反应体系构建可实现自动化，将导出的数据输入计算机软件，可以实现一键分析。真正实现了高通量、低成本、自动化安全检测。

主权项

1.基于KASP技术开发的玉米核心SNP标记，其特征在于，包括22个核心SNP标记，编号分别为LP0009、LP0014、LP0033、LP0068、LP0189、LP0191、LP0209、LP0221、LP0227、LP0242、LP0328、LP0368、LP0376、LP0425、LP0620、LP0629、LP0729、LP0749、LP0782、LP0787、LP0800和LP0902，它们的信息如下：编号染色体SNP物理位置等位基因编号染色体SNP物理位置等位基因LP0009127883004[G/T]LP03683229172879[A/C]LP0014144333421[A/G]LP03769150002028[G/C]LP00331204846790[A/C]LP0425122595305[C/T]LP00681299049227[C/T]LP06204135185331[A/G]LP01894239761848[G/A]LP06294173239725[C/T]LP01914240048629[A/G]LP07296102987176[A/T]LP0209513238813[T/C]LP07496163214059[A/C]LP0221595037309[A/G]LP07827136902532[A/C]LP02275172852124[G/A]LP07877167378729[A/G]LP02425215561608[T/C]LP0800870028786[A/G]LP0328819858353[C/G]LP090210144409391[A/G]上述SNP物理位置是基于玉米B73的全基因组序列确定的，玉米B73全基因组序列的版本号为APGv3。