[发明专利]一种基于机器学习的WSI病灶区域自动标注方法及系统有效
申请号: | 201910656071.X | 申请日: | 2019-07-19 |
公开(公告)号: | CN110378885B | 公开(公告)日: | 2023-07-04 |
发明(设计)人: | 宣宁;王晓骁;尹荣;刘文弟;史丹;王洁 | 申请(专利权)人: | 王晓骁;宣宁 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G16H30/20;G06V10/764;G06V10/44;G06V10/26;G06V10/82;G06N3/0464;G06N3/09 |
代理公司: | 南京苏高专利商标事务所(普通合伙) 32204 | 代理人: | 王恒静 |
地址: | 210029 江苏省南京*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开一种基于机器学习的WSI病灶区域自动标注方法及系统,该方法包括:(1)采集WSI图像数据集,所述数据集中的WSI图像包括无病灶区域的和有病灶区域的生理组织切片,对所述数据集中的所有WSI图像进行预处理,所述预处理包括;(2)对采集的初始训练样本集进行数据增量,形成最终训练样本集,并将部分样本载入构建的卷积神经网络模型中对所述模型进行迭代训练,得到最终预测模型;(3)载入最终训练样本集的剩余样本到所述最终预测模型中,通过样本中的WSI输出标注病灶区域的热度图。本发明经过自动的、大量的深度训练后,可以在杂乱的数据中找到更抽象高层特征,也更具有代表性的特征,从而提高病理看片效率和现有自动检测的准确度。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 机器 学习 wsi 病灶 区域 自动 标注 方法 系统 | ||
【主权项】:
1.一种基于机器学习的WSI病灶区域自动标注方法,其特征在于,该方法包括:(1)采集WSI图像数据集,对所述数据集中的所有WSI图像进行预处理,所述预处理包括:对WSI图像进行染色后,在LAB色彩空间创建生理组织蒙版;使用Chase‑Vese的主动轮廓模型优化所述生理组织蒙版的边缘,确定含有生理组织切片;对所述含有生理组织的切片进行病灶区域的人工标注;对标注后的含有病灶区域的生理组织的切片以及没有病灶区域的生理组织切片进行分割,得到若干含有生理组织的小块后,采集若干病灶小块和正常小块,并均加入到初始训练样本集中;(2)对采集的初始训练样本集进行数据增量,形成最终训练样本集,并将部分样本载入构建的卷积神经网络模型中对所述模型进行迭代训练,得到最终预测模型;(3)载入最终训练样本集的剩余样本到所述最终预测模型中,通过样本中的WSI输出标注病灶区域的热度图。
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