[发明专利]一种人类大脑基因表达时空常模的建立方法

摘要

本发明公开了一种人类大脑基因表达时空常模的建立方法，收集大脑时空原始数据得到基因标准化表达数据集；构建脑区和发育阶段的二维时空框架，将所有基因标准化表达数据按脑区和发育阶段信息对应于所构建的时空框架中，得到单基因时空表达模式；采用基因共表达网络分析方法对所得单基因时空表达矩阵数据进行分析，得到多个基因模块且每个取平均基因表达量得到基因模块时空表达模式；通过对正常人类神经细胞表达数据进行分析，将神经细胞的特征性基因与所得到的基因模块进行富集分析，获得基因模块的细胞表达模式。本发明通过将所有参考数据集最终以相同的二维时空框架呈现，不仅综合不同来源的数据集，有利于研究者直观地对时空框架的内容进行补充和比较。

主权项

1.一种人类大脑基因表达时空常模的建立方法，其特征在于，所述方法包括如下步骤：步骤一、收集大脑时空原始数据，并进行分析、计算，得到每个样本中所有基因标准化表达数据集；步骤二、构建由脑区和发育阶段组成的二维时空框架，将所有基因标准化表达数据按脑区和发育阶段信息对应于所构建的时空框架中，形成基因在行，脑区和发育阶段在列的表达矩阵，得到各基因数据范围内的单基因时空表达模式；步骤三、采用基因共表达网络分析方法对步骤二中所得到的单基因时空表达矩阵数据进行分析，得到多个基因模块，通过对每个基因模块取平均基因表达量，得到基因模块时空表达模式；步骤四、对正常人类神经细胞表达数据进行分析，得到各神经细胞的特征性基因，将神经细胞的特征性基因与步骤三所得到的基因模块进行富集分析，得到与基因模块富集的细胞类型，获得基因模块的细胞表达模式。