[发明专利]FGFR基因融合探针、检测方法和试剂盒

摘要

本发明涉及FGFR基因融合探针、检测方法和试剂盒。本发明提供检测人FGFR基因融合的探针组合，其包括下述探针：FGFR2（NM_001144917）：全部外显子以及1，15,17号内含子区域的探针覆盖；FGFR3（NM_000142）：全部外显子以及17,18号内含子和3’UTR区域的探针覆盖；FGFR3伴侣基因TACC3（NM_006342）第11，14号内含子区域的探针覆盖。本发明还提检测FGFR基因融合的试剂盒，尤其是一次性检测FGFR基因融合的试剂盒以及一种用于分析人类基因FGFR基因融合的自动化装置。本发明适用于广泛样本的检测。

主权项

1.用于检测人类基因FGFR2/3基因融合的探针组合，所述探针组合包括下述探针：针对人TACC3基因所在的4号染色体上起始位点1729490至终止位点1729609的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 501，针对人TACC3基因所在的4号染色体上起始位点1729550至终止位点1729669的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 502，针对人TACC3基因所在的4号染色体上起始位点1729610至终止位点1729729的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 503，针对人TACC3基因所在的4号染色体上起始位点1729670至终止位点1729789的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 504，针对人TACC3基因所在的4号染色体上起始位点1729730至终止位点1729849的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 505，针对人TACC3基因所在的4号染色体上起始位点1729790至终止位点1729909的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 506，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1808662至终止位点1808781的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 72，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1808782至终止位点1808901的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 79，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1808722至终止位点1808841的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 96，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1808692至终止位点1808811的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 269，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1808752至终止位点1808871的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 292，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1808812至终止位点1808931的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 275，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241115至终止位点123241234的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 111，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241175至终止位点123241294的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 158，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241055至终止位点123241174的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 165，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240995至终止位点123241114的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 187，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241295至终止位点123241414的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 193，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241235至终止位点123241354的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 212，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240965至终止位点123241084的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 295，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241145至终止位点123241264的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 306，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241205至终止位点123241324的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 352，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241085至终止位点123241204的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 358，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241025至终止位点123241144的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 380，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241265至终止位点123241384的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 402，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240935至终止位点123241054的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 100，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242135至终止位点123242254的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 106，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123243095至终止位点123243214的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 109，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240755至终止位点123240874的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 113，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240815至终止位点123240934的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 114，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240275至终止位点123240394的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 115，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242195至终止位点123242314的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 121，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240515至终止位点123240634的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 123，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241655至终止位点123241774的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 125，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240335至终止位点123240454的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 128，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240635至终止位点123240754的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 129，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239735至终止位点123239854的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 131，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240695至终止位点123240814的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 133，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241595至终止位点123241714的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 137，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239495至终止位点123239614的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 138，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239915至终止位点123240034的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 139，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242735至终止位点123242854的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 143，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242975至终止位点123243094的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 148，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240455至终止位点123240574的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 149，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240095至终止位点123240214的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 150，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241895至终止位点123242014的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 151，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240215至终止位点123240334的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 153，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242675至终止位点123242794的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 156，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239975至终止位点123240094的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 157，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240575至终止位点123240694的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 160，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123243035至终止位点123243154的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 163，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239855至终止位点123239974的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 164，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240155至终止位点123240274的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 167，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239795至终止位点123239914的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 170，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241775至终止位点123241894的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 171，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242915至终止位点123243034的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 172，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242615至终止位点123242734的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 175，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241955至终止位点123242074的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 182，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240875至终止位点123240994的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 183，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239555至终止位点123239674的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 186，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242255至终止位点123242374的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 188，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240395至终止位点123240514的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 195，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239615至终止位点123239734的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 197，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240035至终止位点123240154的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 199，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242075至终止位点123242194的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 201，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241835至终止位点123241954的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 202，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241715至终止位点123241834的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 207，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242015至终止位点123242134的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 208，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242855至终止位点123242974的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 209，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242555至终止位点123242674的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 215，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239675至终止位点123239794的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 216，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242795至终止位点123242914的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 217，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242165至终止位点123242284的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 301，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123243125至终止位点123243244的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 304，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240785至终止位点123240904的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 308，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240845至终止位点123240964的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 309，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240305至终止位点123240424的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 310，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242225至终止位点123242344的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 316，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241685至终止位点123241804的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 319，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240365至终止位点123240484的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 322，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240665至终止位点123240784的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 323，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239765至终止位点123239884的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 325，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240725至终止位点123240844的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 327，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241625至终止位点123241744的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 331，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239525至终止位点123239644的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 332，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239945至终止位点123240064的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 333，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242765至终止位点123242884的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 337，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123243005至终止位点123243124的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 342，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240485至终止位点123240604的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 343，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240125至终止位点123240244的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 344，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241925至终止位点123242044的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 345，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240245至终止位点123240364的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 347，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242705至终止位点123242824的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 350，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240005至终止位点123240124的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 351，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123243065至终止位点123243184的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 356，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239885至终止位点123240004的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 357，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240185至终止位点123240304的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 360，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239825至终止位点123239944的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 363，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241805至终止位点123241924的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 364，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242945至终止位点123243064的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 365，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242645至终止位点123242764的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 368，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241985至终止位点123242104的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 375，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240905至终止位点123241024的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 376，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239585至终止位点123239704的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 379，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240425至终止位点123240544的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 386，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239645至终止位点123239764的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 387，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123240065至终止位点123240184的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 389，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242105至终止位点123242224的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 391，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241865至终止位点123241984的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 392，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123241745至终止位点123241864的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 397，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242045至终止位点123242164的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 398，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242885至终止位点123243004的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 399，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242585至终止位点123242704的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 405，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123239705至终止位点123239824的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 406，针对人FGFR2基因所在的10号染色体上起始位点123242825至终止位点123242944的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 407，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1809043至终止位点1809162的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 74，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1809163至终止位点1809282的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 78，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1808983至终止位点1809102的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 82，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1809283至终止位点1809402的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 86，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1809223至终止位点1809342的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 91，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1809103至终止位点1809222的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 92，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1809343至终止位点1809462的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 97，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1809193至终止位点1809312的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 274，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1809013至终止位点1809132的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 278，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1809313至终止位点1809432的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 282，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1809253至终止位点1809372的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 287，针对人FGFR3基因所在的4号染色体上起始位点1809133至终止位点1809252的多核苷酸序列或其互补序列，探针序列为SEQ ID No: 288。