[发明专利]用于改善基于扩增子测序的微生物群落分类学解析的方法和系统在审

专利信息
申请号: 201910742535.9 申请日: 2019-08-12
公开(公告)号: CN110819704A 公开(公告)日: 2020-02-21
发明(设计)人: S·S·曼德;A·杜塔;N·K·皮那;M·M·哈克 申请(专利权)人: 塔塔咨询服务有限公司
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;C12Q1/04;G16B30/00
代理公司: 上海专利商标事务所有限公司 31100 代理人: 陈扬扬;钱文宇
地址: 印度马哈*** 国省代码: 暂无信息
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摘要: 发明涉及用于改善基于扩增子测序的微生物群落分类学解析的方法和系统。使用桑格(Sanger)等传统测序方法(较长的读出长度)获得分类学解析需要大量时间。然而,NGS技术(较短的读出长度)的测序涉及大量成本。除此之外,分类学分类的准确度和深度也较低。提供了用于提高基于扩增子测序的对微生物群落的分类学概况分析的准确度的方法和系统。所提出的策略依赖于从两个配对末端测序实验获得微生物群落的分类丰度概况,每个测序实验靶向非连续(或连续)V区的不同成对组合。然后,基于个体V区(实验中靶向)在解析每个所考虑的分类群中的(预估的)准确度,将两个分类学概况组合。
搜索关键词: 用于 改善 基于 扩增 子测序 微生物 群落 分类学 解析 方法 系统
【主权项】:
暂无信息
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