[发明专利]一种基于配体生长策略的蛋白质ATP对接方法有效
| 申请号： | 201910746835.4 | 申请日： | 2019-08-14 |
| 公开（公告）号： | CN110600075B | 公开（公告）日： | 2021-08-03 |
| 发明（设计）人： | 张贵军;饶亮;夏瑜豪;赵凯龙;胡俊;周晓根 | 申请（专利权）人： | 浙江工业大学 |
| 主分类号： | G16B15/30 | 分类号： | G16B15/30;G16B50/30;G16B40/30 |
| 代理公司： | 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 | 代理人： | 王利强 |
| 地址： | 310014 浙江省*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 一种基于配体生长策略的蛋白质ATP对接方法，首先，使用ATPbind服务器预测出蛋白质ATP绑定残基信息，辅助蛋白质与小分子对接；然后，通过将配体分解为多个片段依次进行对接，并使用能量函数优化片段的空间位置，提升了蛋白质‑ATP复合物结构的预测精度；最后，通过使用模拟退火算法快速搜索每一个配体片段的最优空间构象，提高了计算效率。本发明提供一种计算速度快、预测精确性高的基于配体生长策略的蛋白质‑ATP对接方法。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 生长 策略 蛋白质 atp 对接 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于配体生长策略的蛋白质ATP对接方法，其特征在于：所述对接方法包括以下步骤：/n1)输入蛋白质和ATP的结构信息，分别记为R和A；/n2)对于输入的结构信息R，使用ATPbind服务器预测出蛋白质-ATP绑定的残基信息，得出蛋白质与ATP绑定的n个残基，分别记为r
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