[发明专利]一种基于距离和角度信息的蛋白质ATP对接方法有效
申请号: | 201910746836.9 | 申请日: | 2019-08-14 |
公开(公告)号: | CN110600076B | 公开(公告)日: | 2021-11-23 |
发明(设计)人: | 张贵军;饶亮;赵凯龙;夏瑜豪;胡俊;周晓根 | 申请(专利权)人: | 浙江工业大学 |
主分类号: | G16B15/30 | 分类号: | G16B15/30 |
代理公司: | 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 | 代理人: | 王利强 |
地址: | 310014 浙江省*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 一种基于距离和角度信息的蛋白质ATP对接方法,首先,使用ATPbind服务器预测蛋白质‑ATP绑定残基信息辅助预测复合物的结构;生成多种绑定组合方式,增加了构象的多样性;然后,通过种群个体的设计将原先的蛋白质‑ATP结构预测问题转换成搜索最优个体的优化问题,降低了计算代价;最后,设计一种精确的能量函数对生成的构象进行打分,提升了复合物结构的预测精度。本发明提供一种计算代价低、搜索效率高的基于距离和角度信息的蛋白质ATP对接方法。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 距离 角度 信息 蛋白质 atp 对接 方法 | ||
【主权项】:
1.一种基于距离和角度信息的蛋白质ATP对接方法,其特征在于:所述对接方法包括以下步骤:/n1)输入蛋白质和ATP的结构信息,分别记为D和A;/n2)对于输入的蛋白质结构信息D,使用ATPbind服务器预测出蛋白质所有的ATP绑定残基,分别记为r
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