[发明专利]DNA甲基化谱检测方法有效
申请号: | 201910757150.X | 申请日: | 2019-08-16 |
公开(公告)号: | CN110322928B | 公开(公告)日: | 2022-09-13 |
发明(设计)人: | 汤斌华;潘子祥;王真;袁昕阳 | 申请(专利权)人: | 河海大学常州校区 |
主分类号: | G16B20/30 | 分类号: | G16B20/30 |
代理公司: | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人: | 董建林 |
地址: | 213022 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明公开了一种DNA甲基化谱检测方法,对全基因组DNA甲基化信息样本进行统计处理及注释处理,得到全基因组DNA甲基化注释信息,对全基因组DNA甲基化注释信息进行编码,对单甲基化数据进行加窗处理,对窗内各位点分别进行位置与甲基化值建模训练,得到甲基化值预测模型;利用已建立的预测模型按照预设的甲基化谱窗对待测染色体进行逐移预测,得到待测染色体指定位置点的甲基化值。优点:本发明首次提出加窗法结合深度学习算法的思想,通过位点的各类前期标注信息,从而来提高精度,可有效确保辨识分辨模型的可靠性;弥补了工艺上的不足,提高了工艺的精度。 | ||
搜索关键词: | dna 甲基化 检测 方法 | ||
【主权项】:
1.一种DNA甲基化谱检测方法,其特征在于,对全基因组DNA甲基化信息样本进行统计处理及注释处理,得到全基因组DNA甲基化注释信息;对全基因组DNA甲基化注释信息进行编码;对单甲基化数据进行加窗处理;对窗内各位点分别进行位置与甲基化值建模训练,得到甲基化值预测模型;利用已建立的预测模型按照预设的甲基化谱窗对待测染色体进行逐移预测,得到待测染色体指定位置点的甲基化值。
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