[发明专利]一种基于剂量-效应简化转录组的预测化学品胚胎发育毒性的方法有效

专利信息
申请号: 201910788995.5 申请日: 2019-08-26
公开(公告)号: CN110415770B 公开(公告)日: 2022-05-17
发明(设计)人: 张效伟;马聪 申请(专利权)人: 南京大学
主分类号: G16C20/30 分类号: G16C20/30;G16C20/90
代理公司: 江苏瑞途律师事务所 32346 代理人: 陈彬;蒋海军
地址: 210093 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种基于剂量‑效应简化转录组预测化学品胚胎发育毒性的计算方法,属于预测毒理学领域。本发明通过系统地整合高通量测试数据进行打分计算,来预测化学品胚胎毒性,并识别化学品的关键毒性机制。本发明的计算方法以关键事件(KE)间相关证据为依据,利用剂量‑效应简化转录组等高通量分子测试数据对斑马鱼发育相关的有害结局路径(AOP)进行激活打分计算。本发明比传统的胚胎发育毒性测试更加高效、更加敏感,实现了高效的基于化学品致毒机制的毒性预测,可以通过低剂量化学品对早期胚胎转录水平的影响来预测更长生命阶段的发育毒性效应,识别化学品的致毒机制,区分不同致毒模式的化学品。
搜索关键词: 一种 基于 剂量 效应 简化 转录 预测 化学品 胚胎 发育 毒性 方法
【主权项】:
1.一种基于剂量‑效应简化转录组的预测化学品胚胎发育毒性的方法,其特征在于:包括以下步骤:1)利用化学品安全性评估软件计算化学品的畸形指数:对化学品暴露导致的斑马鱼表观畸形的最大无效应浓度值NOEC标准转化后计算畸形指数;2)利用高通量的剂量‑效应的转录水平响应测试,获得生物学通路起始效应浓度;3)从数据库中筛选出与斑马鱼发育畸形相关的有害结局路径,结合有害结局路径中分子起始事件对应的靶向高通量体外测试的结果以及文献搜集的测试结果,构建激活打分算法,进行分子起始事件激活打分;4)在步骤3)中所述的分子起始事件激活打分的基础上,构建有害结局路径激活打分算法,评估化学品对有害结局路径的影响。
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