[发明专利]一种基于序列小生境的多模态蛋白质结构预测方法有效
| 申请号： | 201910793341.1 | 申请日： | 2019-08-27 |
| 公开（公告）号： | CN110706741B | 公开（公告）日： | 2021-08-03 |
| 发明（设计）人： | 张贵军;夏瑜豪;饶亮;刘俊;彭春祥;周晓根 | 申请（专利权）人： | 浙江工业大学 |
| 主分类号： | G16B15/20 | 分类号： | G16B15/20;G16B30/10;G16B35/10 |
| 代理公司： | 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 | 代理人： | 王利强 |
| 地址： | 310014 浙江省*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 一种基于序列小生境的多模态蛋白质结构预测方法，在蒙特卡洛框架下，首先，使用原始的能量函数进行第一轮搜索；然后，根据每次运行后得到的构象信息构造一个用于下一次运行的能量函数，避免构象反复陷入相同的能量陷阱，不仅能够缓解能量函数不精确的问题，而且可以增强采样能力，提高采样效率，从而提升预测精度。本发明提供一种预测精度较高的基于序列小生境的多模态蛋白质结构预测方法。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 序列 小生境 多模态 蛋白质 结构 预测 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于序列小生境的多模态蛋白质结构预测方法，其特征在于：所述方法包括以下步骤：/n1)输入目标蛋白质的序列信息；/n2)根据目标蛋白质序列从ROBETTA服务器获取3片段和9片段的片段库文件；/n3)设置参数：最大迭代次数G，能量函数系数k，降级函数系数m；/n4)设置g＝1，g∈{1,2,...,G}；/n5)构象初始化：利用Rosetta协议第一、二阶段产生一个初始构象
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