[发明专利]数据处理方法在审
| 申请号： | 201910795698.3 | 申请日： | 2019-08-27 |
| 公开（公告）号： | CN110504005A | 公开（公告）日： | 2019-11-26 |
| 发明（设计）人： | 杨圳;王文山 | 申请（专利权）人： | 上海其明信息技术有限公司 |
| 主分类号： | G16B25/10 | 分类号： | G16B25/10;G16B40/00 |
| 代理公司： | 11225 北京金信知识产权代理有限公司 | 代理人： | 刘锋;戎骏京<国际申请>=<国际公布>= |
| 地址： | 201210 上海市浦东新*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明揭示了一种数据处理方法，具体来说涉及ICB‑scSeq技术中的下机数据的处理方法。使用该数据处理方法，能够低成本地、简单地、快速地进行细胞测序，具有相当大的经济效益和安全效益。 | ||
| 搜索关键词： | 数据处理 安全效益 低成本 测序 细胞 | ||
【主权项】：
1.一种数据处理方法，其特征在于，包括：/n原始数据获取步骤，进行双端测序而对用于智能组合条形码法单细胞测序的原始数据进行获取，第一端为cDNA部分，第二端为特异性分子标签以及细胞条形码部分；/n质量控制以及过滤步骤，对所获取的原始数据进行过滤而得到过滤后数据；/n比对步骤，将过滤后数据与参考基因组序列进行比对而得到比对后数据；/n特异性分子标签去重步骤，对比对后数据中的特异性分子标签重复的部分进行去除而得到去重后数据；/n基因定量步骤，对去重后数据进行基因定量而得到定量后数据；/n表达矩阵构建步骤，根据定量后数据构建表达矩阵，该表达矩阵包括了每个细胞中的每个基因的原始计数值；/n细胞筛选步骤，对表达矩阵的线粒体含量和表达基因数目进行筛选而得到筛选后矩阵；/n标准化处理步骤，对筛选后矩阵的原始计数值进行标准化而得到标准化矩阵；/n分析步骤，对标准化矩阵进行分析。/n
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