[发明专利]基于蛋白互作网络的靶点PPIs可药性预测方法及装置有效
| 申请号： | 201910796905.7 | 申请日： | 2019-08-27 |
| 公开（公告）号： | CN110544506B | 公开（公告）日： | 2022-02-11 |
| 发明（设计）人： | 桑运霞;左冰云;阚海亮;宋青芳 | 申请（专利权）人： | 上海源兹生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B15/30 | 分类号： | G16B15/30;G16B20/30;G16B25/10 |
| 代理公司： | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人： | 朱凌娇;许亦琳 |
| 地址： | 200240 上海市闵行*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明提供一种基于蛋白互作网络的靶点PPIs可药性预测方法，至少包括以下步骤：S1：检测PPI网络中互作蛋白结构域的互作关系；S2：探测PPI网络中互作蛋白表面的药物小分子结合口袋；S3：获得PPI网络中互作蛋白的GO功能相似性分值；S4：筛选出同时满足以下条件的PPIs作为药物治疗靶点：蛋白互作关系对存在结构域互作；蛋白互作关系对中，至少有一个蛋白表面存在小分子药物结合口袋；蛋白互作关系对的互作蛋白的GO功能类别中，至少两类具有显著相似性，所述GO功能类别包括GO BP、GO MF和GO CC。本发明同时采用严格的三个相互独立标准全面探索和发现目标PPI，系统排除了假阳性相互作用，选择更可靠的PPIs作为药物靶点，计算结果更符合客观现实。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 蛋白 网络 ppis 药性 预测 方法 装置 | ||
【主权项】：
1.一种基于蛋白互作网络的靶点PPIs可药性预测方法，所述方法至少包括以下步骤：/nS1：检测PPI网络中互作蛋白结构域的互作关系；/nS2：探测PPI网络中互作蛋白表面的药物小分子结合口袋；/nS3：获得PPI网络中互作蛋白的GO功能相似性分值；/nS4：筛选出同时满足以下条件的PPIs作为药物治疗靶点：/ni)蛋白互作关系对存在结构域互作；/nii)蛋白互作关系对中，至少有一个蛋白表面存在小分子药物结合口袋；/niii)蛋白互作关系对的互作蛋白的GO功能类别中，至少两类具有显著相似性，所述GO功能类别包括GO BP、GO MF和GO CC。/n
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