[发明专利]一种适用于混池基因定位的方法及系统有效

专利信息
申请号: 201910811291.5 申请日: 2019-08-30
公开(公告)号: CN110444253B 公开(公告)日: 2023-09-29
发明(设计)人: 黄龙 申请(专利权)人: 上海美吉生物医药科技有限公司
主分类号: G16B20/20 分类号: G16B20/20;G16B50/30
代理公司: 北京哌智科创知识产权代理事务所(普通合伙) 11745 代理人: 何浩
地址: 200120 上海市浦东新区中国(上海)*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种适用于混池基因定位的方法及系统,所述方法包括:标记过滤,基于预设标记质量信息,对分子标记数据进行过滤,获取符合预设质量要求的分子标记数据;统计计算,根据群体情况,对过滤后获取的分子标记数据进行统计计算,获得统计信息;结果整理,对获得的统计信息进行整理,提取基因信息。相比于传统的BSA方法,本发明的方案增加了定位的使用群体范围,能够对F1,F2和其他群体进行定位;且本发明的方案增加了关于分子标记的提前过滤,减少了冗余信息的残留,提高了分析效率。此外,相比于传统的BSA单线程分析方法,本发明通过利用HPC技术,分析速度更快。
搜索关键词: 一种 适用于 基因 定位 方法 系统
【主权项】:
1.一种适用于混池基因定位的方法,其特征在于,所述方法包括:标记过滤,基于预设标记质量信息,对分子标记数据进行过滤,获取符合预设质量要求的分子标记数据;统计计算,根据群体情况,对过滤后获取的分子标记数据进行统计计算,获得统计信息;结果整理,对获得的统计信息进行整理,提取基因信息。
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