[发明专利]挖掘癌症关键生物标记物的方法及装置在审
申请号: | 201910814283.6 | 申请日: | 2019-08-30 |
公开(公告)号: | CN110517786A | 公开(公告)日: | 2019-11-29 |
发明(设计)人: | 赵环宇;封晓娟;黎彤亮;庞超逸 | 申请(专利权)人: | 河北省科学院应用数学研究所 |
主分类号: | G16H50/70 | 分类号: | G16H50/70;G06N3/00 |
代理公司: | 13120 石家庄国为知识产权事务所 | 代理人: | 陈晓彦<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
地址: | 050081 河北*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | 本发明适用于数据挖掘技术领域,提供了一种挖掘癌症关键生物标记物的方法及装置,所述方法包括:获取至少一个癌症患者样本;将所有癌症患者样本作为粒子群中的粒子,对粒子群的各个粒子进行初始化;根据贝叶斯分类模型、粒子群中各个粒子的生物标志物数据及对应的实际生存时间,对各个粒子的速度及位置进行更新;重复粒子更新过程,直至达到预设截止条件,输出所述粒子群当前的全局极值点,并将粒子群当前的全局极值点中选择的生物标志物作为预测生存时间的关键生物标志物。本申请能够从巨量生物标记物数据集合中挖掘出关键的生物标记物组合,有效减少无用或冗余的癌症生物标志物数据,进而提高癌症患者生存期的预测精度。 | ||
搜索关键词: | 粒子群 生物标志物 癌症 粒子 生物标记物 患者样本 极值点 数据挖掘技术 分类模型 截止条件 粒子更新 数据集合 有效减少 冗余 挖掘 贝叶斯 初始化 预测 预设 全局 输出 重复 更新 申请 | ||
【主权项】:
1.一种挖掘癌症关键生物标记物的方法,其特征在于,包括:/nS101:获取至少一个癌症患者样本,每个癌症患者样本均包括多个生物标志物数据及对应的实际生存时间;/nS102:将所有癌症患者样本作为粒子群中的粒子,并将癌症相关的生物标志物作为粒子的向量分量,对所述粒子群的各个粒子进行初始化;/nS103:根据贝叶斯分类模型、所述粒子群中各个粒子的生物标志物数据及对应的实际生存时间,对各个粒子的速度及位置进行更新;/nS104:重复S103,直至达到预设截止条件,输出所述粒子群当前的全局极值点,并将所述粒子群当前的全局极值点中选择的生物标志物作为预测生存时间的关键生物标志物。/n
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