[发明专利]一种提取免疫治疗新抗原的方法及系统有效
| 申请号： | 201910823630.1 | 申请日： | 2019-09-02 |
| 公开（公告）号： | CN110534156B | 公开（公告）日： | 2022-06-17 |
| 发明（设计）人： | 万季;宋麒;潘有东;夏迪;刘鹏;汪健 | 申请（专利权）人： | 深圳市新合生物医疗科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B25/00;C12Q1/6886 |
| 代理公司： | 北京冠和权律师事务所 11399 | 代理人： | 陈国军 |
| 地址： | 518000 广东省深圳市南山*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种提取免疫治疗新抗原的方法及系统，其中方法包括：步骤S1：获取样本肿瘤组织与样本正常组织的常规蛋白质组；步骤S2：获取样本肿瘤组织与样本正常组织的碱基单体单元序列库以及样本肿瘤组织的特异蛋白质组；步骤S3：基于样本肿瘤组织的常规蛋白质组、样本肿瘤组织的特异蛋白质组和人类白细胞抗原HLA分子分型，获得若干候选的肿瘤特异性新抗原；步骤S4：基于所获取的若干候选的肿瘤特异性新抗原，分别计算其在样本肿瘤组织常规蛋白质组、样本正常组织常规蛋白质组、样本肿瘤组织碱基单体单元序列库与样本正常组织碱基单体单元序列库中的存在情况，并与基因表达变化倍数作为过滤规则，获得肿瘤特异性新抗原。从来源上讲，通过本发明的方案发现的肿瘤特异新抗原部分来自基因组非编码区，而不局限于编码区，因此可以发现更多的新抗原。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 提取 免疫 治疗 抗原 方法 系统 | ||
【主权项】：
1.一种提取免疫治疗新抗原的方法，其特征在于，包括：/n步骤S1：获取样本肿瘤组织与样本正常组织的常规蛋白质组；/n步骤S2：获取样本肿瘤组织与样本正常组织的碱基单体单元序列库以及样本肿瘤组织的特异蛋白质组；/n步骤S3：基于所述样本肿瘤组织的常规蛋白质组、样本肿瘤组织的特异蛋白质组和人类白细胞抗原HLA分子分型，获得若干候选的肿瘤特异性新抗原；/n步骤S4：基于所获取的若干所述候选的肿瘤特异性新抗原，分别计算若干所述候选的肿瘤特异性新抗原的特征值，利用预设的规则过滤，获得肿瘤特异性新抗原。/n
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