[发明专利]一种基于结构预测的基因调控网络构建方法有效
| 申请号： | 201910875164.1 | 申请日： | 2019-09-17 |
| 公开（公告）号： | CN110675912B | 公开（公告）日： | 2022-11-08 |
| 发明（设计）人： | 王之琼;郭上慧;曲路渲;信俊昌;钱唯 | 申请（专利权）人： | 东北大学 |
| 主分类号： | G16B5/20 | 分类号： | G16B5/20;G16B25/00 |
| 代理公司： | 沈阳东大知识产权代理有限公司 21109 | 代理人： | 李在川 |
| 地址： | 110819 辽宁*** | 国省代码： | 辽宁;21 |
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| 摘要： | 本发明提供一种基于结构预测的基因调控网络构建方法。包括以下内容：首先计算系数矩阵，通过计算基因之间的Pearson系数、互信息及最大互信息来确定基因之间的相关性，作为筛选潜在父节点集的依据；然后进行结构预测，将获得的基因之间的系数矩阵作为判定基因潜在父节点集的依据，为每个基因选取潜在父节点集；最后进行基因调控网络的结构学习和参数学习。本发明通过基于Person系数、互信息及最大互信息相结合的方法预测基因的潜在父节点集，缩小结构学习的搜索范围，在一定程度上减少了基因调控网络的构建时间，提升计算性能，可以更加快速、准确地构建大规模基因调控网络，进一步了解生物的基因调控机制。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 结构 预测 基因 调控 网络 构建 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于结构预测的基因调控网络构建方法，其特征在于，包括以下步骤：/n步骤1：计算系数矩阵，通过计算基因之间的Pearson系数、互信息及最大互信息来确定基因之间的相关性，作为筛选潜在父节点集的依据；/n步骤2：结构预测，利用步骤1中获得的基因之间的系数矩阵，作为判定基因潜在父节点集的依据，为每个基因选取潜在父节点集；/n步骤3：结构学习，采用基于评分搜索的结构学习方法，评分函数选择BDe分数，并设置每个基因的调控集合的个数为K，对于基因x
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