[发明专利]一种应用支持向量机算法提高结直肠癌指示菌检测灵敏度的方法有效
| 申请号： | 201910877225.8 | 申请日： | 2019-09-17 |
| 公开（公告）号： | CN110781915B | 公开（公告）日： | 2023-06-20 |
| 发明（设计）人： | 孙子奎;宣涛;梁覃斯;蔡庆乐 | 申请（专利权）人： | 上海派森诺生物科技股份有限公司 |
| 主分类号： | G06F18/2411 | 分类号： | G06F18/2411;G06F18/214 |
| 代理公司： | 上海天翔知识产权代理有限公司 31224 | 代理人： | 吕伴 |
| 地址： | 200030 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种应用支持向量机算法提高结直肠癌指示菌检测灵敏度的方法，其特征在于，通过选择ΔCt值作为基础数值，选择指示菌与便潜血FIT(拟合)指标的组合作为指示指标；以及基于支持向量机方法和核函数、惩罚系数、gamma值的参数和相应的模型的优化测试来获得更为准确的结直肠癌鉴别方法。本发明的有益效果在于：本发明的SVM优化算法结合优选的指示菌引物组合与便潜血FIT指标组合较便潜血FIT检测准确度高；较未经优化的SVM算法鉴别准确度高；较未经优化的指示菌引物组合与便潜血FIT指标组合准确度高。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 应用 支持 向量 算法 提高 直肠癌 指示菌 检测 灵敏度 方法 | ||
【主权项】：
1.一种应用支持向量机算法提高结直肠癌指示菌检测灵敏度的方法，其特征在于，包括如下步骤：/n步骤一：规范输入参考集数据文件格式为csv格式；/n步骤二：读取数据，筛选需要使用的指标，选择ΔCt值作为基础数值，选择指示菌与FIT(拟合)指标的组合作为指示指标；/n步骤三：在所有参考样本中，取70％的样本作为训练集，剩下的作为验证集；/n步骤四：选择支持向量机方法，初始化分类器；/n步骤五：使用训练集进行支持向量机算法的参数选优和训练；所述参数包括：核函数、惩罚系数、gamma值；/n步骤六：使用上一步选优得到的包括核函数、惩罚系数、gamma值的参数和相应的模型，利用验证集里的特征数据进行预测，得到验证集的预测结果；/n步骤七：根据验证集的预测结果和真实结果对比，计算出本方法的敏感度和特异性；/n步骤八：按照规范输入待检测样本的数据文件，用上述通过指示菌和核函数、惩罚系数、gamma值优选后的方法进行分析，输出结直肠癌鉴别结果文件和检测报告。/n
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