[发明专利]蛋白质三级结构的预测方法及系统有效
| 申请号： | 201910907112.8 | 申请日： | 2019-09-24 |
| 公开（公告）号： | CN110689918B | 公开（公告）日： | 2022-12-09 |
| 发明（设计）人： | 薛雅琪 | 申请（专利权）人： | 上海宽慧智能科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B5/00 | 分类号： | G16B5/00;G16B15/20;G06N3/04 |
| 代理公司： | 上海段和段律师事务所 31334 | 代理人： | 李佳俊;郭国中 |
| 地址： | 200050 上海市长宁区虹桥*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种蛋白质三级结构的预测方法及系统，包括：网络结构搭建步骤；两个头输出设置步骤；距离概率分布获取步骤；角度概率分布获取步骤；损失函数l构造步骤；参数集获取步骤；拟合步骤；神经网络的学习步骤；预测结果计算步骤。共同预测的双头共享神经网络架构不仅仅能够解决距离和角度预测的不一致性，提升角度和距离预测的精确度，同时也大幅度减少计算的时间，加速预测速度。 | ||
| 搜索关键词： | 蛋白质 三级 结构 预测 方法 系统 | ||
【主权项】：
1.一种蛋白质三级结构的预测方法，其特征在于，包括：/n网络结构搭建步骤：搭建距离和角度预测的双头共享神经网络结构，获取神经网络建模结构信息、残差网络模型信息；/n两个头输出设置步骤：根据神经网络建模结构信息，前N层后设置两个头的输出，分别获取距离输出头信息、角度输出头信息；/n距离概率分布获取步骤：根据距离输出头信息，输入特征，利用前N层的共享残差网络模型，距离输出头产生两个氨基酸残基对的距离的概率分布d(i，j)的输出，获取距离概率分布信息；/n角度概率分布获取步骤：根据角度输出头信息，输入特征，利用前N层的共享残差网络模型，角度输出头产生一个氨基酸残基的扭转角角度概率分布a(i)的输出，获取角度概率分布信息；/n损失函数l构造步骤：/n-根据距离概率分布信息、角度概率分布信息，获取预测距离信息、预测角度信息；/n-根据预测距离信息、预测角度信息，构造双头共享神经网络的损失函数l；/n参数集获取步骤：将最终训练好的共同距离和角度预测的共享神经网络表示为(d,a)，则其函数f表示为给定蛋白质序列seq上的共享神经网络的参数集θ的计算：/n(d,a)＝f
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