[发明专利]泛癌种肿瘤新生抗原高通量预测方法及其应用有效
申请号: | 201910941228.3 | 申请日: | 2019-09-30 |
公开(公告)号: | CN110706742B | 公开(公告)日: | 2020-06-30 |
发明(设计)人: | 程旭东;管旭东 | 申请(专利权)人: | 中生康元生物科技(北京)有限公司 |
主分类号: | G16B15/30 | 分类号: | G16B15/30;G16B20/20;G16B30/10 |
代理公司: | 北京预立生科知识产权代理有限公司 11736 | 代理人: | 朱萍;李红伟 |
地址: | 102206 北京市昌平*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了一种泛癌种肿瘤新生抗原高通量预测方法及其应用。本申请的预测方法以二代测序原始数据文件为基础进行突变和MHC检测,从多维度对候选肿瘤新生抗原进行打分,不仅可以降低新生抗原筛选的假阳性,而且可以把可信度高的新生抗原通过打分排序筛选出来。本发明的方法可以适用于多癌种,不需要区分癌种便可以预测肿瘤新生抗原,为基于肿瘤新生抗原的免疫治疗奠定了基础。 | ||
搜索关键词: | 泛癌种 肿瘤 新生 抗原 通量 预测 方法 及其 应用 | ||
【主权项】:
1.一种评估泛癌种肿瘤新生抗原可信度的打分函数,其特征在于,所述打分函数包括如下特征值:突变多肽亲和力、多肽数量、突变多肽和正常多肽亲和力比值、突变所在位置基因或者转录本表达量、突变位点RNA的变异频率、DNA碱基突变的变异频率。/n
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