[发明专利]用于检测循环肿瘤DNA突变的质控品及其制备方法在审

专利信息
申请号: 201910957380.0 申请日: 2019-10-10
公开(公告)号: CN110578002A 公开(公告)日: 2019-12-17
发明(设计)人: 张之宏;李文洁;吕娟;汉雨生;吴文君 申请(专利权)人: 广州燃石医学检验所有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6806
代理公司: 11105 北京市柳沈律师事务所 代理人: 张晓飞;凃滔
地址: 510320 广东省广州市广*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 本公开涉及一种制备用于循环肿瘤DNA(ctDNA)突变检测技术的质控品的方法和通过该方法制备的质控品。本公开还涉及该质控品在检测ctDNA突变和相关方法例如微滴式数字PCR(ddPCR)、扩增阻滞突变系统PCR(ARMS)PCR和高通量测序(NGS)中的用途。
搜索关键词: 质控品 制备 突变检测技术 高通量测序 突变系统 循环肿瘤 数字PCR 扩增 微滴 阻滞 突变 检测
【主权项】:
1.一种制备用于循环肿瘤DNA(ctDNA)突变检测技术的质控品的方法,所述方法包括:/na.将来自不具有目标基因突变的野生型细胞系的基因组DNA酶切消化以获得野生型DNA片段;/nb.获得包含目标基因突变序列的突变型DNA片段和/或包含目标基因拷贝数变异的突变型DNA片段,/n其中获得包含目标基因突变序列的突变型DNA片段包括:/ni)将来自多种突变型细胞系的基因组DNA各自酶切消化并将所得DNA片段混合,所述多种细胞系各自包含一种或多种目标基因序列突变;/nii)将多种质粒酶切消化并将所得DNA片段混合,所述多种质粒各自包含一种或多种目标基因突变序列;或者/niii)将包含多种目标基因突变序列的一种质粒酶切消化以获得DNA片段;/n其中获得包含目标基因拷贝数变异的突变型DNA片段包括:/n将一种或多种细菌人工染色体DNA酶切消化并将所得的DNA片段混合,所述一种或多种细菌人工染色体各自包含一种拷贝数变异的目标基因的拷贝;/nc.将来自步骤a的野生型DNA片段和来自步骤b的包含目标基因序列突变的突变型DNA片段和/或包含目标基因拷贝数变异的突变型DNA片段混合,从而获得所述质控品。/n
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