[发明专利]一种基于线粒体全基因组对台湾东风螺系统发育分析方法在审
| 申请号： | 201910974636.9 | 申请日： | 2019-10-14 |
| 公开（公告）号： | CN110714063A | 公开（公告）日： | 2020-01-21 |
| 发明（设计）人： | 叶莹莹;许中天;冯鉴童 | 申请（专利权）人： | 浙江海洋大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/6806;G16B20/00 |
| 代理公司： | 33109 杭州杭诚专利事务所有限公司 | 代理人： | 尉伟敏 |
| 地址： | 316022 浙江省*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种基于线粒体全基因组对台湾东风螺系统发育分析方法，涉及台湾东风螺系统发育分析领域，包括以下步骤：1）样本采集：采集台湾东风螺提取线粒体基因组DNA；2）将线粒体基因组DNA打断、纯化后构建DNA测序文库；3）获得DNA簇；4）对螺线粒体基因组DNA测序；5）与其他已知序列的东风螺进行比较，随后对编码蛋白基因基因注释；6）将台湾东风螺线粒体基因组DNA的每个基因的核苷酸序列及其推导的氨基酸序列与其他新腹足目物种的进行比对，并将其串联起来进行系统发育分析，本发明基于线粒体全基因组对台湾东风螺系统发育进行分析，得到了完整的台湾东风螺线粒体全基因组数据，进行系统发育进行分析方便有效。 | ||
| 搜索关键词： | 线粒体基因组 线粒体全基因组 系统发育分析 编码蛋白基因 发育 氨基酸序列 核苷酸序列 测序文库 基因注释 样本采集 已知序列 比对 对螺 腹足 构建 推导 串联 打断 分析 采集 物种 基因 | ||
【主权项】：
1.一种基于线粒体全基因组对台湾东风螺系统发育分析方法，其特征在于，包括以下步骤：/n1）样本采集：采集台湾东风螺，采用盐析法从肌肉组织中提取线粒体基因组DNA，冷冻保存；/n2）将线粒体基因组DNA打断、纯化后构建DNA测序文库；/n3）将线粒体基因组DNA打断成片段，获得DNA簇；/n4）采用高通量测序法对台湾东风螺线粒体基因组DNA进行测序；/n5）将台湾东风螺线粒体基因组DNA与其他已知序列的东风螺进行比较，随后对编码蛋白基因基因注释；/n6）将台湾东风螺线粒体基因组DNA的每个基因的核苷酸序列及其推导的氨基酸序列与其他新腹足目物种的进行比对，并将其串联起来进行系统发育分析。/n
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