[发明专利]测序序列处理方法及装置、存储介质、电子设备有效
申请号: | 201910990372.6 | 申请日: | 2019-10-17 |
公开(公告)号: | CN110797087B | 公开(公告)日: | 2020-11-03 |
发明(设计)人: | 张凯;何新军;沈一鸣 | 申请(专利权)人: | 南京医基云医疗数据研究院有限公司 |
主分类号: | G16B30/10 | 分类号: | G16B30/10;G16B40/00 |
代理公司: | 北京律智知识产权代理有限公司 11438 | 代理人: | 王辉;阚梓瑄 |
地址: | 210000 江苏省南京市江北新区*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明实施例是关于一种测序序列处理方法及装置、存储介质、电子设备,涉及生物信息处理技术领域,该方法包括:获取在对待测序序列与参考测序序列进行映射时得到的多个完全匹配子串;根据各所述完全匹配子串与所述参考测序序列之间的欧氏距离对各所述完全匹配子串进行分组得到多个子串组;根据预设排序规则对各所述子串组进行排序,并对排序后的各所述子串组中的各所述完全匹配子串进行处理得到处理结果;在确认所述处理结果满足预设条件时,将该处理结果作为所述待测序序列的对齐结果。本发明实施例提高对排序后的各子串组中的各完全匹配子串进行处理的效率,进而提高了对待测序序列进行比对的效率。 | ||
搜索关键词: | 序列 处理 方法 装置 存储 介质 电子设备 | ||
【主权项】:
1.一种测序序列处理方法,其特征在于,包括:/n获取在对待测序序列与参考测序序列进行映射时得到的多个完全匹配子串;/n根据各所述完全匹配子串与所述参考测序序列之间的欧氏距离对各所述完全匹配子串进行分组得到多个子串组;/n根据预设排序规则对各所述子串组进行排序,并对排序后的各所述子串组中的各所述完全匹配子串进行处理得到处理结果;/n在确认所述处理结果满足预设条件时,将该处理结果作为所述待测序序列的对齐结果。/n
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