[发明专利]一种基于深度混合网络的单细胞转录组缺失值填补方法有效

专利信息
申请号: 201911072613.5 申请日: 2019-11-05
公开(公告)号: CN110957009B 公开(公告)日: 2023-05-12
发明(设计)人: 何尧;谢志;袁皓 申请(专利权)人: 中山大学中山眼科中心
主分类号: G16B40/00 分类号: G16B40/00
代理公司: 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 代理人: 林丽明
地址: 510060 广*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明提供的一种基于深度混合网络的单细胞转录组缺失值填补方法,包括:对单细胞测序并进行预处理,得到表达矩阵并进行标准化处理;构建基于深度学习的混合模型,将标准化后的表达矩阵输入混合模型中进行循环计算,得到多个预测表达矩阵;计算每一次循环的权重,将多个预测表达矩阵按照对应的权重进行加权平均,得到的结果为混合模型的填补输出,完成对缺失值的填补。本发明提供的填补方法,借助深度神经网络对复杂函数的拟合能力适应单细胞的表达分布,保证了本填补方法对各类单细胞转录组数据的通用性;同时保留了深度学习在超大细胞数目的数据集上的可拓展性,完成了对单细胞转录组缺失值的填补,显著提高了单细胞数据解读的可靠性。
搜索关键词: 一种 基于 深度 混合 网络 单细胞 转录 缺失 填补 方法
【主权项】:
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