[发明专利]一种基于深度混合网络的单细胞转录组缺失值填补方法有效
申请号: | 201911072613.5 | 申请日: | 2019-11-05 |
公开(公告)号: | CN110957009B | 公开(公告)日: | 2023-05-12 |
发明(设计)人: | 何尧;谢志;袁皓 | 申请(专利权)人: | 中山大学中山眼科中心 |
主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 林丽明 |
地址: | 510060 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明提供的一种基于深度混合网络的单细胞转录组缺失值填补方法,包括:对单细胞测序并进行预处理,得到表达矩阵并进行标准化处理;构建基于深度学习的混合模型,将标准化后的表达矩阵输入混合模型中进行循环计算,得到多个预测表达矩阵;计算每一次循环的权重,将多个预测表达矩阵按照对应的权重进行加权平均,得到的结果为混合模型的填补输出,完成对缺失值的填补。本发明提供的填补方法,借助深度神经网络对复杂函数的拟合能力适应单细胞的表达分布,保证了本填补方法对各类单细胞转录组数据的通用性;同时保留了深度学习在超大细胞数目的数据集上的可拓展性,完成了对单细胞转录组缺失值的填补,显著提高了单细胞数据解读的可靠性。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 深度 混合 网络 单细胞 转录 缺失 填补 方法 | ||
【主权项】:
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