[发明专利]一种寡核苷酸库的均一化方法有效
申请号: | 201911087247.0 | 申请日: | 2019-11-08 |
公开(公告)号: | CN110699428B | 公开(公告)日: | 2021-04-20 |
发明(设计)人: | 齐浩;郜艳敏 | 申请(专利权)人: | 天津大学 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 刘猛 |
地址: | 300354 天津*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | 本发明涉及生物技术领域,公开了一种寡核苷酸库的均一化方法。本发明可先将寡核苷酸库通过PCR的方式进行总量的放大,降低寡核苷酸合成成本;同时采用平均分子数加入等量的捕获探针,使各寡核苷酸分子数都趋于平均数,拉近各单链寡核苷酸的浓度,整个过程可以进行多次循环,达到理论上各寡核苷酸的绝对化均一;此外,配合磁珠吸附技术,可高效、简便的纯化寡核苷酸库,相比HLPC和PAGE纯化方法更加优异。 | ||
搜索关键词: | 一种 寡核苷酸 均一 方法 | ||
【主权项】:
1.一种寡核苷酸库的均一化方法,其特征在于,包括:/n步骤1、将初始单链寡核苷酸库以及DNA标准品进行凝胶电泳,依据电泳结果,通过灰度分析DNA标准品与寡核苷酸库,计算出初始单链寡核苷酸库的平均分子数;或/n将初始双链寡核苷酸库采用正、反向引物对双链寡核苷酸库进行PCR扩增,其中正向或反向引物5’末端带有磷酸基团;PCR扩增后,lambda外切酶识别带有磷酸基团的一条链并进行降解,得到总量放大的单链寡核苷酸库;将所述总量放大的单链寡核苷酸库以及DNA标准品进行凝胶电泳,依据电泳结果,通过灰度分析DNA标准品与所述总量放大的单链寡核苷酸库,计算出所述总量放大的单链寡核苷酸库的平均分子数;/n步骤2、按平均分子数加入单链寡核苷酸库中每种单链寡核苷酸的捕获探针,经过杂交,高于平均分子数的单链寡核苷酸没有被捕获会处于游离状态,而低于平均分子数的单链寡核苷酸会全部被捕获,多余的捕获探针处于游离状态;捕获完成之后,经聚合酶聚合,然后将游离的单链寡核苷酸以及捕获探针经外切酶I降解,使各单链寡核苷酸分子数都趋于平均数,拉近各单链寡核苷酸的浓度,得到浓度相对均一的双链寡核苷酸文库;其中,所述捕获探针根据每种单链寡核苷酸序列设计,且5’末端带有磷酸基团;/n步骤3、重复步骤1至步骤2零次或一次以上。/n
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