[发明专利]一种筛选特征mRNA用于诊断早期肺癌的方法在审
申请号: | 201911146308.6 | 申请日: | 2019-11-14 |
公开(公告)号: | CN110751983A | 公开(公告)日: | 2020-02-04 |
发明(设计)人: | 李艳坤;马昕鹏;董汝南;庞佳烽;景璟 | 申请(专利权)人: | 华北电力大学(保定) |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00;G16H50/00 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 071003 河北省保定市*** | 国省代码: | 河北;13 |
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摘要: | 本发明公开了一种通过非相关线性判别分析模型筛选特征mRNA用于诊断早期肺癌的方法。首先对己知肺癌样本和正常样本的mRNA表达数据进行标准化处理,将其作为训练集。然后采用非相关线性判别分析对训练集进行建模,得到每个变量对应的转换矩阵G。将标准化后的待诊断样本作为预测集,将其mRNA表达数据与G矩阵相乘,得到非相关判别矢量值,从而进行肺癌样本的识别诊断。通过每个mRNA对应的G的绝对值大小筛选出特征mRNA,并不断调整筛选阈值以减少mRNA保留数量并更新肺癌诊断ULDA模型,直到预测集诊断准确度开始下降。诊断准确度为100%时,所筛选出的最少数目的mRNA可以作为肺癌诊断的潜在特征生物标记物。 | ||
搜索关键词: | 诊断 肺癌 样本 线性判别分析 准确度 肺癌诊断 训练集 预测集 筛选 相乘 标准化处理 生物标记物 模型筛选 正常样本 转换矩阵 矢量 建模 标准化 保留 更新 | ||
【主权项】:
1.一种筛选特征mRNA用于诊断早期肺癌的方法,其特征在于,包括如下步骤:/n步骤一,已知肺癌样本和正常样本的mRNA表达数据进行标准化处理,将其作为训练集;/n步骤二,对训练集进行非相关线性判别分析,计算出变量对应的转换矩阵G;/n步骤三,将标准化后的待诊断样本作为预测集,将其mRNA表达数据与G矩阵相乘,得到非相关判别矢量值,从而进行肺癌样本与正常样本的识别诊断;/n步骤四,转换矩阵G绝对值的平均值为
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