[发明专利]一种分子指纹生成方法在审

专利信息
申请号: 201911172854.7 申请日: 2019-11-26
公开(公告)号: CN112951337A 公开(公告)日: 2021-06-11
发明(设计)人: 王晓华;杨民民 申请(专利权)人: 南京药石科技股份有限公司
主分类号: G16C20/20 分类号: G16C20/20;G16C20/40;G16C20/70
代理公司: 南京经纬专利商标代理有限公司 32200 代理人: 葛潇敏
地址: 210032 江*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开一种分子指纹生成方法,包括如下步骤:步骤1,建立训练集,该训练集为分子的smiles表示;步骤2,分别按照基团和字符对步骤1训练集中的各smiles表示进行分割,假设训练集中包含有N条smiles,则分割后共得到2*N条数据;然后使用TFIDF算法对得到的2*N条数据进行训练;步骤3,将经过TFIDF算法处理的smiles合成为向量,然后计算其中的原子位置信息;步骤4,在分子中叠加按基团和字符经计算后的分子向量表征,并叠加按原子计算的位置信息,以此来表示分子smiles。此种方法可实现“端到端”的分子指纹生成框架,无需手工提取特征,解决了分子指纹生成方法需要开发者对领域知识有较深了解的难题。
搜索关键词: 一种 分子 指纹 生成 方法
【主权项】:
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