[发明专利]一种鉴定二代靶向捕获测序样本微生物污染的方法和装置在审

专利信息
申请号: 201911215087.3 申请日: 2019-12-02
公开(公告)号: CN110867211A 公开(公告)日: 2020-03-06
发明(设计)人: 许明炎;黄探霄;刘明;陈实富;廖雯婷 申请(专利权)人: 深圳市海普洛斯生物科技有限公司
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B50/30
代理公司: 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 代理人: 张海平
地址: 518000 广东省深圳市*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 本申请涉及基因测序和生物信息学技术领域,提供了一种鉴定二代靶向捕获测序样本中的微生物污染的方法和相应的用于执行该方法的装置和计算机可读存储介质。该方法包括靶向捕获测序原始数据处理步骤、与人类参考基因组比对步骤、严重微生物污染判断步骤,还包括样本中污染微生物种类和含量鉴定步骤。本发明的方法可以定性地鉴定测序样本中是否存在严重微生物污染,并进一步定量地鉴定出污染微生物的种类和含量,在临床样本的测序和分析中将具有重大应用前景。
搜索关键词: 一种 鉴定 二代 靶向 捕获 样本 微生物 污染 方法 装置
【主权项】:
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