[发明专利]一种基于Spark SQL的RefGene基因库的注释方法和装置在审
| 申请号： | 201911218063.3 | 申请日： | 2019-12-03 |
| 公开（公告）号： | CN111199778A | 公开（公告）日： | 2020-05-26 |
| 发明（设计）人： | 吕宁;吕致;陈彦萍 | 申请（专利权）人： | 西安邮电大学 |
| 主分类号： | G16B50/30 | 分类号： | G16B50/30 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 710100 陕西*** | 国省代码： | 陕西;61 |
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| 摘要： | 本发明的实施方式提供了一种基于Spark SQL的RefGene基因库的注释方法。该方法包括：生成以染色体正链和负链为区分的区间森林；使用Spark系统的广播机制，广播已经生成区间森林；使用待注释变异的指定字段，查询区间森林；对返回的查询结果与待注释的表执行内连接操作；输出包含注释结果的表。在执行本流程一遍之后，如果返回的注释结果不为空则执行本流程第二遍，用于注释该变异是否属于外显子。此外，本发明的实施方式提供了一种基于Spark SQL的RefGene基因库的注释装置。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 spark sql refgene 基因库 注释 方法 装置 | ||
【主权项】：
暂无信息
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