[发明专利]面向分子动力学模拟程序的数据存储与索引方法及系统有效
| 申请号： | 201911275994.7 | 申请日： | 2019-12-12 |
| 公开（公告）号： | CN111125892B | 公开（公告）日： | 2021-10-12 |
| 发明（设计）人： | 储根深;白鹤;陈丹丹;贺新福;杨文;胡长军 | 申请（专利权）人： | 北京科技大学 |
| 主分类号： | G06F30/20 | 分类号： | G06F30/20;G06F119/14 |
| 代理公司： | 北京市广友专利事务所有限责任公司 11237 | 代理人： | 张仲波 |
| 地址： | 100083*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： |
本发明提供一种面向分子动力学模拟程序的数据存储与索引方法及系统，所述方法包括：依据分子动力学模拟程序中每个MPI进程上所模拟的空间大小初始化hash表，利用初始化后的hash表存储分子动力学模拟程序中的粒子信息；使用偏移列表预先存储邻居晶格点的偏移量；在分子动力学模拟程序的每一个时间步循环中，对于每一个粒子，使用所述偏移列表遍历其邻居粒子，以计算邻居粒子对当前粒子的作用力。本发明的面向分子动力学模拟程序的数据存储与索引方法可以大大节省存储空间，邻居粒子索引速度更加高效，从而可以突破10 |
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| 搜索关键词： | 面向 分子 动力学 模拟 程序 数据 存储 索引 方法 系统 | ||
【主权项】：
暂无信息
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