[发明专利]基于基因序列的物种快速查找及建库方法、系统和介质有效

专利信息
申请号: 201911283115.5 申请日: 2019-12-13
公开(公告)号: CN111063394B 公开(公告)日: 2023-07-11
发明(设计)人: 马丑贤;李根;王振国;冯博伦;徐霞丽;杨耀;杨仁武;蒋艳凰 申请(专利权)人: 人和未来生物科技(长沙)有限公司
主分类号: G16B50/30 分类号: G16B50/30;G06F16/903
代理公司: 湖南兆弘专利事务所(普通合伙) 43008 代理人: 邹大坚;刘畅舟
地址: 410000 湖南省长沙市长沙高*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明公开了一种基于基因序列的物种快速查找方法,包括以下步骤:1)输入包含待查找的未知物种的特征信息的集合A,所述特征信息包括未知物种的采样基因序列子序列及其反向互补序列中字典序的最小值K*j,i1、采样基因序列子序列在所属基因序列中的起始位置Pj,i1以及判断K*j,i1是否为采样基因序列子序列反向互补序列的逻辑符号Dj,i1;2)将集合A分别与预设的已知物种数据库匹配计算相似性;3)根据相似性最大的匹配结果确定待查找基因序列的物种查找结果。本发明通过设置未知物种的采样基因序列子序列及其反向互补序列中字典序的最小值K*j,i1,将待查询基因序列中反向互补的子序列调整为序列相同,减少了需要匹配的子序列种类,从而在进行查询时提升了效率。
搜索关键词: 基于 基因 序列 物种 快速 查找 方法 系统 介质
【主权项】:
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