[发明专利]蛋白质信号肽及其切割位点预测实现方法有效
| 申请号： | 201911317226.3 | 申请日： | 2019-12-19 |
| 公开（公告）号： | CN111091871B | 公开（公告）日： | 2022-02-18 |
| 发明（设计）人： | 张维洵;潘小勇;沈红斌 | 申请（专利权）人： | 上海交通大学 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G06N3/04;G06N3/08 |
| 代理公司： | 上海交达专利事务所 31201 | 代理人： | 王毓理;王锡麟 |
| 地址： | 200240 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 一种基于融合领域规则和深度学习的蛋白质信号肽及其切割位点预测实现方法，以待测氨基酸序列的PSSM和HMM合成其氨基酸序列表征后，依次通过序列级分类和残基级分类得到待测氨基酸序列是否包含信号肽、跨膜螺旋或属于非分泌蛋白以及每个残基具体属于信号肽、切割位点或成熟蛋白质，再根据预测结果进行加权合并后以最大统计分数对应的位点作为最终预测出的信号肽切割位点。本发明利用深度模型直接分类信号肽、跨膜螺旋及非分泌蛋白，通过在biLSTM网络上结合自注意力机制显著提升了识别蛋白质信号肽切割位点识别的精度。 | ||
| 搜索关键词： | 蛋白质 信号肽 及其 切割 预测 实现 方法 | ||
【主权项】：
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