[发明专利]基于扩散距离的关键蛋白质识别方法在审
申请号: | 201911371809.4 | 申请日: | 2019-12-26 |
公开(公告)号: | CN111128296A | 公开(公告)日: | 2020-05-08 |
发明(设计)人: | 胡赛;赵碧海;熊慧军;韩笑;刘馨儿 | 申请(专利权)人: | 长沙学院 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00 |
代理公司: | 安化县梅山专利事务所 43005 | 代理人: | 潘访华 |
地址: | 410022 湖*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于扩散距离的关键蛋白质识别方法,包括以下步骤:根据蛋白质相互作用网络拓扑结构建立无向加权网络,并将无向加权网络表征为无向图邻接矩阵M;根据蛋白质同源信息和亚细胞定位信息计算得到初始距离向量ID;根据无向图邻接矩阵M和初始距离向量ID,迭代地计算蛋白质间的扩散距离以得到扩散距离矩阵MD;根据扩散距离矩阵MD,挖掘重叠功能模块;根据重叠功能模块,对候选蛋白质评分,并输出TOP K的蛋白质为识别的关键蛋白质。本发明改进了关键蛋白质识别方法研究中多源生物数据的融合方式,降低了相互作用网络中假阳性和假阴性对预测造成的负面影响,大大提高了关键蛋白质的识别准确率。 | ||
搜索关键词: | 基于 扩散 距离 关键 蛋白质 识别 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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