[发明专利]一种结肠腺癌基因组变异与肿瘤进化关系的研究方法在审
申请号: | 201911399391.8 | 申请日: | 2019-12-30 |
公开(公告)号: | CN111785322A | 公开(公告)日: | 2020-10-16 |
发明(设计)人: | 祝让飞 | 申请(专利权)人: | 杭州慕谷基因科技有限公司 |
主分类号: | G16B20/20 | 分类号: | G16B20/20;G16B20/50;G16B20/10 |
代理公司: | 昆明合众智信知识产权事务所 53113 | 代理人: | 钱磊 |
地址: | 311100 浙江省杭州*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明涉及基因组变异技术领域,且公开了一种结肠腺癌基因组变异与肿瘤进化关系的研究方法,包括以下步骤:S1、数据下载;S2、数据预处理:TCGA数据预处理:A、对TCGA的临床样本数据做以下预处理:a、去掉没有临床信息或者生存时间小于30天的样本;b、去掉正常组织样本数据;B、对突变数据做以下预处理:a、去掉silent和intron突变位点。该种结肠腺癌基因组变异与肿瘤进化关系的研究方法,收集来自TCGA的结肠腺癌(COAD)基因组的数据,并从其体细胞突变(SSNV)和拷贝数变异(SCNV)的组库中推断出每个肿瘤样本的克隆(亚克隆)组成,利用该肿瘤克隆系统发育数据,进一步评估肿瘤内异质性与基因组不稳定性关系,从而使这些特征可以作为潜在肿瘤复杂性的标志。 | ||
搜索关键词: | 一种 结肠 腺癌 基因组 变异 肿瘤 进化 关系 研究 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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