[发明专利]用于Sanger测序的深度碱基识别器在审
| 申请号： | 201980082101.9 | 申请日： | 2019-12-10 |
| 公开（公告）号： | CN113168890A | 公开（公告）日： | 2021-07-23 |
| 发明（设计）人： | 储勇;S·施奈德;R·谢弗;D·吴 | 申请（专利权）人： | 生命科技股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/20 | 分类号： | G16B30/20;G16B40/20 |
| 代理公司： | 上海专利商标事务所有限公司 31100 | 代理人： | 陈依心;黄嵩泉 |
| 地址： | 美国加利*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 提供了一种用于Sanger测序的深度碱基识别器系统和相关方法。这些方法使用深度机器学习。使用深度学习模型，基于分析的迹线来确定扫描标签概率。训练神经网络学习最佳映射函数以使连接时序列分类(CTC)损失函数降至最低。CTC函数用于通过匹配目标序列和预测的扫描标签概率来计算损失。解码器生成具有最大概率的序列。使用前缀束搜索的碱基识别测位仪用于遍历CTC标签概率以查找扫描范围，然后针对每个被识别碱基的扫描范围内的峰值标签概率的位置。使用从CTC标签概率计算的特征向量作为QV查找表中的索引来确定质量值(QV)，以查找质量分数。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 sanger 深度 碱基 识别 | ||
【主权项】：
暂无信息
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