[发明专利]一种基于基因组分析的癌症分期预测系统有效
申请号: | 202010003411.1 | 申请日: | 2020-01-03 |
公开(公告)号: | CN111180009B | 公开(公告)日: | 2023-04-28 |
发明(设计)人: | 张海霞;李芳君;袁东风 | 申请(专利权)人: | 山东大学 |
主分类号: | G16B20/00 | 分类号: | G16B20/00;G16B40/00 |
代理公司: | 济南金迪知识产权代理有限公司 37219 | 代理人: | 许德山 |
地址: | 250199 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | 本发明涉及一种基于基因组分析的癌症分期预测系统,包括依次连接的原始数据采集单元、组合特征预处理单元、联合基因选择单元、分类模型创建单元、预测单元;原始数据采集单元用于:获取癌症基因组图谱TCGA项目对应癌症亚型样本的RNAseq表达数据及临床信息,获取其中基因表达的RSEM值;组合特征预处理单元用于:离散化遗传特征;或者,添加1.0之后,使用log2转换RSEM值,并标准化log2转换后的RSEM值;联合基因选择单元用于:依次进行FCBF搜索、联合统计特征提取、logistic回归模型特征选择;分类模型创建单元用于生成分类模型,并优化其性能;本发明预测表现上面更稳定、更准确。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 基因组 分析 癌症 分期 预测 系统 | ||
【主权项】:
暂无信息
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