[发明专利]一种基于深度学习的CRISPR脱靶效应预测方法有效
申请号: | 202010030316.0 | 申请日: | 2020-01-12 |
公开(公告)号: | CN111261223B | 公开(公告)日: | 2022-05-03 |
发明(设计)人: | 彭绍亮;陈东;舒文杰;李肯立;骆嘉伟;刘云浩;刘凡;刘阳辉;刘浩 | 申请(专利权)人: | 湖南大学 |
主分类号: | G16B15/30 | 分类号: | G16B15/30;G16B30/00;G16B40/00 |
代理公司: | 国防科技大学专利服务中心 43202 | 代理人: | 王文惠 |
地址: | 410012 湖*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | 本发明属于生物信息学领域,公开了一种基于深度学习的CRISPR脱靶效应预测方法,通过使用BERT模型对人类基因组进行信息的抽取,有效地利用基因组的先验信息,并对数据进行有效地加强,最后将获取到的特征输入到LightGBM方法中进行训练预测,本发明解决了数据量少和数据不平衡的问题,并实现了对CRISPR脱靶效应的有效预测,具有十分重要的推广应用价值。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 深度 学习 crispr 脱靶 效应 预测 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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