[发明专利]一种基于角度特征的短时序基因表达数据聚类方法有效
| 申请号： | 202010060429.5 | 申请日： | 2020-01-19 |
| 公开（公告）号： | CN111276188B | 公开（公告）日： | 2023-03-24 |
| 发明（设计）人： | 李爱民;刘雅君;裴广胜;刘光明;费蓉;周红芳;王磊;黑新宏 | 申请（专利权）人： | 西安理工大学 |
| 主分类号： | G16B30/00 | 分类号： | G16B30/00;G16B40/00;G06F18/23 |
| 代理公司： | 北京国昊天诚知识产权代理有限公司 11315 | 代理人： | 杨洲 |
| 地址： | 710048*** | 国省代码： | 陕西;61 |
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| 摘要： | 一种基于角度特征的短时序基因表达数据聚类方法，包括以下步骤：步骤1，计算角度特征；步骤2，用Affinity Propagation聚类算法聚类；步骤3，获得功能显著的类；把基因表达变化趋势相似的基因聚为一类，同属于一类的基因有功能相似的趋势；对于每一个基因，相邻时间点的基因表达的变化可以计算出角度特征，反映基因表达的局部变化趋势；对于每个时间点，用换算后的角度间接反映整体的表达水平情况；以这些角度为特征，皮尔森相关系数作为相似性测度，相关系数越大，表示两个基因的表达谱越相似；然后用Affinity Propagation聚类算法聚类；具有聚类结果更能反映基因功能、聚类结果做功能富集分析的p值更小的特点。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 角度 特征 时序 基因 表达 数据 方法 | ||
【主权项】：
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