[发明专利]检测人类基因组病毒整合位点的方法及装置有效
| 申请号： | 202010121537.9 | 申请日： | 2020-02-26 |
| 公开（公告）号： | CN110957008B | 公开（公告）日： | 2020-06-23 |
| 发明（设计）人： | 蒙裕欢;关宇佳;严慧;孟博;于世辉 | 申请（专利权）人： | 广州市金域转化医学研究院有限公司;广州金域医学检验集团股份有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G16B40/30 |
| 代理公司： | 广州新诺专利商标事务所有限公司 44100 | 代理人： | 李海恬 |
| 地址： | 510000 广东省广州市开*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种检测人类参考基因组病毒整合位点的方法及装置，属于基因检测生物信息学分析技术领域。该方法包括：基因组比对、滑动切割、短序列比对、整合步骤。该方法将同时没有比对到人类参考基因组及病毒基因组的reads进行滑动切割，将切割后的子序列（或称短序列）重新进行比对，通过比对的位置及某条reads分割序列顺序的聚类、相关性及协方差处理，并在分析过程中，可列举所有高度可能的比对位置，可以准确找出同时比对上人类参考基因组及病毒基因组的reads，精准定位，误差范围在3bp以内。并且该方法计算资源要求不高，运行速度快，具有较高的实用价值。 | ||
| 搜索关键词： | 检测 人类基因组 病毒 整合 方法 装置 | ||
【主权项】：
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