[发明专利]一种基于混合烟花算法的分子构象搜索方法有效
申请号: | 202010194528.2 | 申请日: | 2020-03-19 |
公开(公告)号: | CN111402964B | 公开(公告)日: | 2023-07-25 |
发明(设计)人: | 李瑾;刘伟超;杨佳艳 | 申请(专利权)人: | 西南医科大学 |
主分类号: | G16C20/20 | 分类号: | G16C20/20 |
代理公司: | 重庆中之信知识产权代理事务所(普通合伙) 50213 | 代理人: | 邓锋 |
地址: | 646000 四川*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | 本发明提供了一种基于混合烟花算法的分子构象搜索方法,其特征在于:包含以下步骤:S1、设置受体分子的对接区域,用对接盒子表示,对接盒子用于存放配体构象;S2、初始化若干个初始烟花,每个烟花代表一个配体构象;将配体构象表示为解向量,设置受体‑配体的结合亲和力打分函数为适应度函数;S3、由解向量构建解空间,解空间包含若干个层次;S4、构建烟花算法的算子;S5、结合烟花算法与局部搜索算法构建混合烟花算法,利用混合烟花算法搜索对接盒子内的近似最优配体构象。本发明减少了分子对接中测试复合物上对接的平均用时,提高了分子对接的速度;同时能够找到适应度函数的近似最优值,提高了分子对接的精度。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 混合 烟花 算法 分子 构象 搜索 方法 | ||
【主权项】:
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