[发明专利]基于SIMD的哈希函数的基因序列快速分类方法及系统有效
| 申请号： | 202010196384.4 | 申请日： | 2020-03-19 |
| 公开（公告）号： | CN111370064B | 公开（公告）日： | 2023-05-05 |
| 发明（设计）人： | 刘卫国;徐晓明;殷泽坤 | 申请（专利权）人： | 山东大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B40/00;G06F18/241;G06F18/22 |
| 代理公司： | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人： | 黄海丽 |
| 地址： | 250101 *** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本公开公开了基于SIMD的哈希函数的基因序列快速分类方法及系统，包括：基于单指令多数据流SIMD改进的哈希函数，构建已知基因序列的哈希值列表；基于单指令多数据流SIMD改进的哈希函数，构建待分类序列的哈希列表；基于已构建的已知基因序列的哈希值列表和待分类序列的哈希列表，采用基于统计学的抽样算法，将待分类基因序列的向量与所有已知类型基因序列的哈希值进行相似性比较，当相似性高于设定阈值的时候，判断参与碰撞检测的两条序列的相似性高，从而待分类序列属于相似性最高的已知序列的类别。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 simd 函数 基因 序列 快速 分类 方法 系统 | ||
【主权项】：
暂无信息
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