[发明专利]筛选候选插入片段的方法和系统在审
申请号: | 202010207885.8 | 申请日: | 2020-03-23 |
公开(公告)号: | CN113436683A | 公开(公告)日: | 2021-09-24 |
发明(设计)人: | 黄慧雅;曹玉冰;刘乙齐;郭亚琨 | 申请(专利权)人: | 北京合生基因科技有限公司 |
主分类号: | G16B30/00 | 分类号: | G16B30/00;G16B40/00;C12N15/11;C12N15/13 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 肖阳 |
地址: | 102206 北京市昌平*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提出了一种筛选候选插入片段的方法,所述插入片段用于改造待测样本核酸序列。该方法包括:基于用于改造待测样本核酸序列的候选基因,确定初始基因编码区序列;对所述初始基因编码区序列进行同义密码子替换,以便获得由多个候选编码区序列构成的候选编码区序列集合;将所述候选编码区序列与自身、宿主基因组和病毒基因组进行比对,并确定同源性高风险区域,以便对所述候选编码区序列进行同源性风险评分;和基于所述同源性风险评分,在所述候选编码区序列集合中确定优选编码区序列子集。 | ||
搜索关键词: | 筛选 候选 插入 片段 方法 系统 | ||
【主权项】:
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