[发明专利]基于系统进化树的泛基因组构建方法和构建装置在审
申请号: | 202010260748.0 | 申请日: | 2020-04-03 |
公开(公告)号: | CN111477281A | 公开(公告)日: | 2020-07-31 |
发明(设计)人: | 张锦波;鲍冠辉;李季 | 申请(专利权)人: | 北京诺禾致源科技股份有限公司;北京诺禾致源生物科技有限公司;天津诺禾致源生物信息科技有限公司;天津诺禾医学检验所有限公司;南京诺禾致源生物科技有限公司 |
主分类号: | G16B40/30 | 分类号: | G16B40/30;G16B30/10 |
代理公司: | 北京康信知识产权代理有限责任公司 11240 | 代理人: | 路秀丽 |
地址: | 102200 北京市昌平区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供了一种基于系统进化树的泛基因组构建方法和构建装置。该构建方法包括:对不同株系的菌株进行系统进化树构建,得到系统进化树;根据不同株系的菌株在系统进化树上的不同位置,按照从底层到顶层的方向两两聚类,逐层进行泛基因组构建,得到不同株系总的泛基因组。该方法从底层到顶层的泛基因组构建,不仅解决了现有方法中比对结果不准确的问题,而且使得每一个进化节点的泛基因组都可以得到,从而可以从更加细致的进化角度来分析存在/缺失变异结果。 | ||
搜索关键词: | 基于 系统 进化 基因组 构建 方法 装置 | ||
【主权项】:
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