[发明专利]一种基于半监督学习框架的T细胞受体序列分类方法有效

专利信息
申请号: 202010291254.9 申请日: 2020-04-14
公开(公告)号: CN111489792B 公开(公告)日: 2022-12-09
发明(设计)人: 王嘉寅;边浩东;易鑫;张选平;王科;刘涛 申请(专利权)人: 西安交通大学;北京吉因加科技有限公司
主分类号: G16B40/20 分类号: G16B40/20;G06K9/62
代理公司: 西安通大专利代理有限责任公司 61200 代理人: 高博
地址: 710049 *** 国省代码: 陕西;61
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摘要: 发明公开了一种基于半监督学习框架的T细胞受体序列分类方法,选取CDR3β区域作为输入数据,对T细胞受体数据进行特征编码;根据得到的数据,选择支持向量机、随机森林和决策树的监督学习算法分别构造初始分类器C1、C2、C3;对初始分类器C1、C2、C3进行训练得到扩充的新训练集,产生的训练集进行可重复取样获得三个有标记训练集,然后从每个新训练集产生一个分类器,对分类器进行迭代更新;训练完成后,将三个分类器C1、C2、C3通过投票机制作为一个分类器集成进行使用。本发明适用于T细胞受体序列数据难以获得的情况,性能显著优于现有方法。
搜索关键词: 一种 基于 监督 学习 框架 细胞 受体 序列 分类 方法
【主权项】:
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