[发明专利]一种提高质谱磷酸化修饰位点鉴定通量和准确性的方法有效
| 申请号： | 202010318724.6 | 申请日： | 2020-04-21 |
| 公开（公告）号： | CN111489789B | 公开（公告）日： | 2021-10-15 |
| 发明（设计）人： | 薛宇;周嘉琦;林少峰;王晨玮 | 申请（专利权）人： | 华中科技大学 |
| 主分类号： | G16B20/30 | 分类号： | G16B20/30;G16B40/00 |
| 代理公司： | 华中科技大学专利中心 42201 | 代理人： | 许恒恒;李智 |
| 地址： | 430074 湖北*** | 国省代码： | 湖北;42 |
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| 摘要： | 本发明属于生物信息领域，公开了一种提高质谱磷酸化修饰位点鉴定通量和准确性的方法，包括以下步骤：(1)将磷酸化组质谱数据库中多个样本的质谱鉴定磷酸化修饰组原始数据用多种搜库引擎按假阳性率FDR要求进行重新搜库；(2)去冗合并得到训练集；(3)将训练集作为机器学习输入样本，构建基于训练数据的机器学习模型；(4)利用模型对位点进行预测得到每个位点的打分排序，再利用该打分筛选出FDR满足目标FDR要求的位点，从而得到各搜库引擎工具整合之后的总位点。本发明通过对方法的整体处理流程的设计进行改进，同时采用多种搜库引擎，能够有效克服现有技术中对于蛋白质磷酸化修饰位点鉴定无法跨样本、准确性差和通量低方面的缺陷。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 提高 磷酸化 修饰 鉴定 通量 准确性 方法 | ||
【主权项】：
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